MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Shewanella amazonensis SB2B chromosome

Total Repeats: 9189

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008700	GGC	2	6	2368	2373	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_008700	TTCC	2	8	3516	3523	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_008700	TG	4	8	3602	3609	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008700	TATT	2	8	3620	3627	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008700	AAT	2	6	3679	3684	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008700	GGT	2	6	4564	4569	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008700	TTG	2	6	4593	4598	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008700	GGC	2	6	5211	5216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_008700	ATA	2	6	5238	5243	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008700	AATC	2	8	5247	5254	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11	NC_008700	GA	3	6	5286	5291	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_008700	AT	3	6	6409	6414	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_008700	TGTT	2	8	6422	6429	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_008700	GGTG	2	8	6430	6437	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
15	NC_008700	A	7	7	6447	6453	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_008700	A	6	6	10387	10392	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_008700	AAG	2	6	10428	10433	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18	NC_008700	T	6	6	10465	10470	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_008700	CTT	2	6	10471	10476	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_008700	TAA	2	6	10596	10601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_008700	CTC	2	6	10737	10742	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_008700	T	6	6	10756	10761	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_008700	TTG	2	6	13288	13293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008700	CGA	2	6	14456	14461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008700	GA	4	8	14460	14467	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008700	GAA	2	6	16901	16906	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008700	A	7	7	16905	16911	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_008700	T	6	6	16930	16935	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_008700	AG	3	6	16968	16973	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_008700	TCT	2	6	22107	22112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_008700	A	7	7	22119	22125	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_008700	CCA	2	6	22130	22135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_008700	TGT	2	6	22159	22164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_008700	CTGA	2	8	22250	22257	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_008700	GGAA	2	8	22319	22326	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008700	A	6	6	23404	23409	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008700	T	6	6	23426	23431	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008700	TGCTAC	2	12	23444	23455	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_008700	CTG	2	6	26463	26468	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_008700	AAT	2	6	27143	27148	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_008700	A	6	6	27160	27165	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_008700	AGGAA	2	10	27214	27223	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
43	NC_008700	GTT	2	6	30500	30505	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008700	ATA	2	6	30549	30554	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008700	AGC	2	6	30871	30876	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_008700	CAG	2	6	31119	31124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_008700	GTG	2	6	31133	31138	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008700	T	6	6	33171	33176	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008700	TTTGGT	2	12	33178	33189	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008700	TGCT	2	8	36529	36536	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_008700	CAT	2	6	36595	36600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_008700	TGC	2	6	36610	36615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_008700	A	6	6	36629	36634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_008700	ACA	2	6	36643	36648	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_008700	GGC	2	6	36677	36682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_008700	GCACA	2	10	36713	36722	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
57	NC_008700	CAA	2	6	38759	38764	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_008700	TGA	2	6	38779	38784	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
59	NC_008700	GAT	2	6	41215	41220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_008700	ATG	2	6	41291	41296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_008700	ATG	2	6	41344	41349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_008700	CAAT	2	8	47653	47660	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_008700	ACA	2	6	47689	47694	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_008700	TC	3	6	47734	47739	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_008700	GACC	2	8	48850	48857	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_008700	A	6	6	50399	50404	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_008700	T	6	6	50423	50428	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_008700	CTA	2	6	50744	50749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_008700	AGAT	2	8	50827	50834	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_008700	CAG	2	6	50835	50840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_008700	AGC	2	6	50869	50874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_008700	CTG	2	6	50918	50923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_008700	GT	3	6	50960	50965	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_008700	TGG	2	6	50975	50980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008700	GATAT	2	10	51060	51069	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
76	NC_008700	TAA	2	6	53467	53472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_008700	GCT	2	6	53969	53974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_008700	T	6	6	55723	55728	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008700	CAGGT	2	10	55753	55762	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_008700	A	6	6	55785	55790	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008700	A	7	7	55792	55798	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_008700	GCG	2	6	55874	55879	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_008700	GGT	2	6	55889	55894	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
84	NC_008700	TG	3	6	56047	56052	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_008700	TGA	2	6	56066	56071	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_008700	CAG	2	6	56122	56127	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_008700	GGC	2	6	56187	56192	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_008700	GCG	2	6	56253	56258	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_008700	AGG	2	6	56348	56353	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_008700	TAG	2	6	56400	56405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_008700	CGA	2	6	56428	56433	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_008700	GCA	2	6	56502	56507	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_008700	GT	3	6	56555	56560	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_008700	GAA	2	6	56561	56566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_008700	GGA	2	6	56597	56602	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
96	NC_008700	AGA	2	6	56644	56649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_008700	CAG	2	6	56670	56675	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_008700	G	6	6	56817	56822	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
99	NC_008700	GGA	2	6	56861	56866	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
100	NC_008700	GGC	2	6	56881	56886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_008700	GAA	2	6	57124	57129	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_008700	TGC	2	6	57200	57205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_008700	GTC	2	6	57212	57217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_008700	CCTTAT	2	12	57264	57275	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_008700	GGA	2	6	57326	57331	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_008700	GAC	2	6	57339	57344	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_008700	TCA	2	6	57351	57356	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_008700	AC	3	6	57377	57382	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
109	NC_008700	TCG	2	6	57444	57449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_008700	AC	3	6	57546	57551	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
111	NC_008700	CCT	2	6	57687	57692	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_008700	CTG	2	6	57713	57718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_008700	CA	3	6	57725	57730	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_008700	TAG	2	6	57798	57803	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
115	NC_008700	TCAA	2	8	57854	57861	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_008700	TTC	2	6	57874	57879	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
117	NC_008700	GTA	2	6	58017	58022	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_008700	GTA	2	6	58045	58050	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
119	NC_008700	TCA	2	6	58104	58109	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_008700	GCG	2	6	58202	58207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_008700	GGC	2	6	58324	58329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_008700	TGT	2	6	58340	58345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
123	NC_008700	G	6	6	58354	58359	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
124	NC_008700	TCC	2	6	58364	58369	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
125	NC_008700	CTGA	2	8	58384	58391	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
126	NC_008700	GGA	2	6	58674	58679	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_008700	CGG	2	6	58896	58901	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_008700	CGTC	2	8	58909	58916	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_008700	AAC	2	6	58928	58933	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_008700	AGC	2	6	59018	59023	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_008700	CAT	2	6	59024	59029	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_008700	AAAG	2	8	59032	59039	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
133	NC_008700	AGTCG	2	10	59054	59063	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
134	NC_008700	TGAAGG	2	12	59159	59170	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
135	NC_008700	GA	3	6	59371	59376	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
136	NC_008700	GTTG	2	8	59401	59408	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
137	NC_008700	GGT	2	6	59420	59425	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
138	NC_008700	CA	3	6	59452	59457	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_008700	TGA	2	6	59470	59475	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_008700	TCT	2	6	59523	59528	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
141	NC_008700	GGT	2	6	59569	59574	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
142	NC_008700	GA	3	6	59599	59604	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_008700	GCT	2	6	59657	59662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_008700	ATTG	2	8	59802	59809	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_008700	CGG	2	6	59850	59855	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
146	NC_008700	ATG	2	6	59926	59931	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
147	NC_008700	ACC	2	6	60121	60126	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
148	NC_008700	TGG	2	6	60182	60187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
149	NC_008700	TCC	2	6	60208	60213	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
150	NC_008700	GGA	2	6	60225	60230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
151	NC_008700	GACA	2	8	60302	60309	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_008700	GGT	2	6	60345	60350	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
153	NC_008700	CGG	2	6	60432	60437	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
154	NC_008700	TCA	2	6	60460	60465	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_008700	CGT	2	6	60540	60545	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_008700	G	6	6	60589	60594	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
157	NC_008700	GAAC	2	8	60622	60629	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_008700	GT	3	6	60793	60798	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
159	NC_008700	GTA	2	6	60877	60882	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
160	NC_008700	TTGA	2	8	60905	60912	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_008700	AGT	2	6	61092	61097	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_008700	AGC	2	6	61105	61110	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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164	NC_008700	ATT	2	6	61222	61227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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166	NC_008700	TTA	2	6	62769	62774	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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169	NC_008700	CGG	2	6	66805	66810	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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175	NC_008700	AGCCC	2	10	67505	67514	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
176	NC_008700	GATT	2	8	67553	67560	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
177	NC_008700	TAGG	2	8	67563	67570	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
178	NC_008700	T	7	7	69124	69130	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_008700	TG	3	6	70430	70435	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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184	NC_008700	ACC	2	6	70578	70583	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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187	NC_008700	GCT	2	6	70713	70718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
188	NC_008700	TTC	2	6	70732	70737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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279	NC_008700	AAT	2	6	104175	104180	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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282	NC_008700	A	6	6	104286	104291	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
283	NC_008700	CT	3	6	104497	104502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
284	NC_008700	TGC	2	6	104562	104567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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288	NC_008700	AAC	2	6	107561	107566	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
289	NC_008700	GAA	2	6	107593	107598	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
290	NC_008700	TGT	2	6	107609	107614	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
291	NC_008700	ATT	3	9	107617	107625	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
292	NC_008700	ATC	2	6	107667	107672	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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294	NC_008700	GCGA	2	8	107714	107721	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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298	NC_008700	TGG	2	6	109763	109768	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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303	NC_008700	G	6	6	112275	112280	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
304	NC_008700	TAT	2	6	112940	112945	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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422	NC_008700	GCA	2	6	192393	192398	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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424	NC_008700	AGG	2	6	192475	192480	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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426	NC_008700	AGTG	2	8	193025	193032	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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429	NC_008700	GGAT	2	8	193192	193199	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
430	NC_008700	GTC	2	6	193733	193738	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
431	NC_008700	GGT	2	6	193745	193750	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
432	NC_008700	TTC	2	6	193754	193759	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
433	NC_008700	GCG	2	6	193770	193775	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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435	NC_008700	TGA	2	6	193847	193852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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441	NC_008700	A	8	8	195673	195680	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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454	NC_008700	TAA	2	6	213109	213114	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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456	NC_008700	ATT	2	6	213127	213132	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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464	NC_008700	TTA	2	6	220612	220617	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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466	NC_008700	A	6	6	222428	222433	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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472	NC_008700	A	6	6	223894	223899	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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